در این فصل به توصیف خصوصیات تعدادی از لیزرهای متداول در میکروسکوپ فلورسانس می پردازیم. ما در خصوص ویژگی های لیزرها در رابطه با استفاده از آنها به عنوان منبع روشنایی متمرکز شده ایم. لیزرها در مقایسه با سایر منابع ساطع کننده اشعه الکترومغناطیسی ، مانند لامپهای قوس ، دارای تعدادی خاصیت منحصر به فرد هستند که آنها را به یک منبع نوری تقریباً ایده آل برای استفاده در میکروسکوپ کانفوکال تبدیل می کند. این خصوصیات عبارتند از:
درجه بالایی از تک رنگ
واگرایی کوچک
روشنایی بالا
درجه بالایی از انسجام مکانی و زمانی
انتشار قطبش هواپیما (برای بسیاری از انواع)
نمای پرتو گاوسی (می توان با اپتیک مخصوص به دست آورد)