| ش | ی | د | س | چ | پ | ج |
| 1 | 2 | 3 | 4 | |||
| 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 |
| 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 |
| 19 | 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 |
| 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 |
چالش‌های عمده در کاربردهای بیوفوتونیکی در علوم زیستی شامل نحوه جمع‌آوری نور کم توان ساطع شده (تا محدوده nW) از یک نمونه بافت و انتقال آن به آشکارساز فوتون، نحوه تحویل طیف وسیعی از سطوح توان نوری به بافت است. منطقه یا بخش در طول دسته های مختلف جلسات مراقبت های بهداشتی درمانی، و نحوه دسترسی به یک منطقه تشخیصی یا درمانی در یک موجود زنده با یک کاوشگر تشخیص نوری یا یک منبع انرژی تابشی به حداقل روش تهاجمی. خواص فیزیکی و انتقال نور منحصر به فرد فیبرهای نوری آنها را قادر می سازد تا به حل چنین مسائل اجرایی کمک کنند. این فصل زمینه‌ای را ارائه می‌کند که برای درک نحوه عملکرد فیبرهای نوری ضروری است و دسته‌های مختلفی از فیبرهایی را که به صورت تجاری برای استفاده در بیوفوتونیک در دسترس هستند، توضیح می‌دهد.