مدرسه تابستانی بیوفوتونیک سال 1401

مدرسه تابستانی بیوفوتونیک

بیو فوتونیک، حسگر پیشرفته، و تصویربرداری پیشرفته

فوتونیک سبز، انرژی و فناوری‌های مرتبط

فناوری لیزر پرقدرت، اپتیک فوق سریع و کاربردها

اپتیک غیرخطی، نانوفوتونیک و پلاسمونیک

ارتباطات نوری

مواد فوتونیک

فوتونیک و هوش مصنوعی

طراحی و شبیه سازی تئوری فوتونیک

برهمکنش‌های کوانتومی نور-ماده: سنجش، ارتباطات و پردازش اطلاعات

کارآفرینی و نوآوری فناوری فوتونیک

وضوح فوق العاده، STED، ICS و رامان

این روز طیف گسترده ای از تکنیک های تصویربرداری پیشرفته را پوشش می دهد. به طور خاص، تکنیک‌های وضوح فوق‌العاده شامل میکروسکوپ کاهش انتشار تحریک‌شده (STED)، میکروسکوپ روشنایی ساخت‌یافته (SIM) و میکروسکوپ‌های مبتنی بر محلی‌سازی مانند میکروسکوپ محلی‌سازی قابل فعال‌سازی نوری (PALM) معرفی خواهند شد.

پراکندگی رامان ضد استوکس منسجم (CARS) و تصویربرداری رامان هم کانونی ارائه خواهد شد. آنها تکنیک تصویربرداری بدون برچسب هستند که کاملاً بر اساس ارتعاشات مولکولی است. این دوره شامل مقدمه ای بر اصول اولیه کار و انتخاب ابزار دقیق از جمله لیزر، میکروسکوپ و طیف سنج خواهد بود. علاوه بر این، مقدمه ای برای پیش پردازش و تجزیه و تحلیل داده های تصویربرداری رامان وجود خواهد داشت.

علاوه بر این، روش‌هایی برای اندازه‌گیری‌های دینامیکی در نمونه‌ها مانند طیف‌سنجی همبستگی فلورسانس (FCS) و طیف‌سنجی همبستگی تصویر فضای k (kICS) نشان داده خواهد شد. این تکنیک‌ها اندازه‌گیری ضریب انتشار حجیم را از تصویربرداری کانفوکال معمولی، فلورسانس epi یا TIRF تسهیل می‌کنند.

تک ذره و پروتئین های فلورسنت

این ماژول از سه بخش تشکیل خواهد شد. بخش اول تئوری و کاربردهای منتخب میکروسکوپ بازتاب داخلی کل (TIRF) با نسبت سیگنال به نویز بالا و وضوح فضایی در مطالعات فلورسانس تک مولکولی و FRET را شرح می‌دهد.

بخش بعدی بر نحوه مطالعه قاچاق گیرنده با استفاده از فناوری های تصویربرداری متمرکز خواهد بود. ما روش‌هایی را برای دنبال کردن گیرنده‌های اندوسیتی از سطح و از طریق سیستم اندوسومی دنبال می‌کنیم و نشان می‌دهیم که چگونه گیرنده‌ها در سلول‌های اندوتلیال و اپیتلیال پلاریزه شده ترانس سیتوز شوند.

بخش آخر بر چگونگی استفاده از پروتئین های فلورسنت و روش های تصویربرداری زیستی برای مطالعه اثرات کانال های آب آکواپورین بر مهاجرت سلولی و چسبندگی سلولی متمرکز خواهد بود.

علاوه بر سخنرانی‌ها، این ماژول شامل یک تمرین ImageJ در ردیابی سلول‌های زنده و مهاجر و همچنین یک تور تسهیلات خواهد بود.

تجزیه و تحلیل تصویر - مقدمه ای بر پایتون

در این قسمت از دوره آموزشی، شما یک مقدمه سریع برای پردازش تصویر با استفاده از پایتون خواهید داشت. با استفاده از رایانه شخصی خود، یاد خواهید گرفت که چگونه برنامه های کوتاهی بنویسید که کاهش نویز ساده، تقسیم بندی و تجزیه و تحلیل شی را روی تصاویر دو بعدی انجام می دهند. ما با نمونه‌هایی از تصاویر کار خواهیم کرد و می‌توانید تصاویر خود را به عنوان موارد کار بیشتر بیاورید. قبل از کلاس، انتظار می رود که Anaconda را نصب کرده باشید و با نوت بوک Jupyter آشنایی اولیه داشته باشید. اگر تجربه برنامه نویسی در پایتون ندارید، اکیداً توصیه می شود که از طریق مطالب مقدماتی برنامه نویسی پایتون کار کنید تا قبل از کلاس توزیع شود.

میکروسکوپ کانفوکال

دانش آموزان با اصول و ملزومات میکروسکوپ اسکن تک نقطه ای آشنا می شوند. سخنرانی‌ها و تمرین‌های عملی عملی برای آموزش اجزای حیاتی یک میکروسکوپ کانفوکال و نحوه درست ساختن مسیرهای نور تصویربرداری و تنظیمات برای جلوگیری از مصنوعات و جمع‌آوری داده‌های تصویربرداری زیستی مناسب به دانش‌آموزان آموزش داده می‌شود.

میکروسکوپ دو فوتونی و فلورسانس

این روز اصول اولیه میکروسکوپ میدان وسیع فلورسانس و اپی فلورسانس را پوشش می‌دهد که پایه‌ای برای درک بسیاری از تکنیک‌های پیشرفته‌تر معرفی‌شده بعداً در دوره است. پس از آن مقدمه ای بر میکروسکوپ تحریک چند فوتونی با کاربردها و مقدمه ای کوتاه برای تجزیه و تحلیل تصویر با استفاده از تصویر خواهد بود.

گروه آموزشی مهندس شکوفه ساتری

دوره دکتری تصویربرداری زیستی

دوره دکتری تصویربرداری زیستی

شرح دوره

دکتری تصویربرداری زیستی متقابل نهادی این دوره توسط یک سری مدرس ارائه می شود که در هر زمینه تصویربرداری زیستی خود متخصص هستند. این دوره در موسسات تحقیقاتی مختلف برگزار می شود تا دانش آموزان را در معرض گروه های مختلف تحقیقاتی، محققان و امکانات تحقیقاتی تجربی قرار دهد. بنابراین، این دوره فرصتی منحصر به فرد را به دانش آموزان می دهد تا خود را در یک زمینه فعال و متنوع از علوم بین رشته ای در تصویربرداری زیستی جهت دهی کنند.

این دوره برای دانشجویان دکترا در رشته های پزشکی، فیزیک، شیمی، بیوشیمی، زیست شناسی مولکولی، علوم زیستی نانو، علوم دارویی، علوم کشاورزی یا زیست شناسی مرتبط است. تاکید این دوره، توری از تمام تکنیک‌های تصویربرداری زیستی موجود  است و موضوعاتی مانند تصویربرداری سلول زنده، میکروسکوپ کانفوکال، میکروسکوپ الکترونی، میکروسکوپ با وضوح فوق‌العاده، تکنیک‌های تک ذره، میکروسکوپ کاهش انتشار تحریک‌شده، تصویربرداری از سلول‌های عصبی، مهاجرت سلولی را پوشش می‌دهد. و تجزیه و تحلیل تصویر

بیوفوتونیک با شکوفه ساتری

اهداف یادگیری:

دانش آموزی که به اهداف دوره رسیده باشد با موارد زیر آشنا خواهد بود:

میکروسکوپ میدان وسیع

میکروسکوپ کانفوکال اسکن لیزری

میکروسکوپ دو فوتونی

میکروسکوپ کانفوکال دیسک چرخشی

طیف‌سنجی همبستگی فلورسانس و همبستگی تصویر شطرنجی (FCS و RICS)

میکروسکوپ با وضوح فوق العاده؛ STED، SIM و میکروسکوپ های محلی سازی

جمع آوری و تجزیه و تحلیل خودکار تصاویر

میکروسکوپ پراکنده منسجم ضد رامان (CARS)

تجزیه و تحلیل تصویر